分为经典分子动力学（经典 MD）与从头算分子动力学（AIMD），分别基于经典力学与量子力学，在分子尺度上追踪原子/分子的运动轨迹。仅依赖力场参数或电子结构计算，即可动态解析原子级运动过程，为实验机理阐释与宏观性质预测提供核心理论支撑，广泛应用于催化、材料、生物医药等领域。

适用体系金属、合金、氧化物、分子筛、二维材料、钙钛矿、锂电电解质、催化剂表界面、生物大分子等。
可模拟过程吸附、扩散、相变、离子输运、自组装等动态微观过程。